解析：

A选项，我国城市居民最低生活保障人员中登记失业人员占总人数的24.3%，未登记失业人员占总人数的17.2%，总共占总人数的24.3%＋17.2%＝41.5%，超过了40%，A项正确；
B选项，我国城市居民最低生活保障人员中在职人员占总人数的3.5%，灵活就业人员占总人数的1.3%，在校生占总人数的15.3%，总共占总人数的3.5%＋1.3%＋15.3%＝20.1%，故失业人员约为就业人员的41.5%÷20.1%≈2倍，B项正确；
C选项，我国城市居民最低生活保障人员中老年人316.7万人，占总人数的13.6%，这里的总人数指的是城市居民最低生活保障人数，不是城市老年人总数，C项错误；
D选项，由城市最低生活保障图可以看出2003年至2004年城市居民最低生活保障人数年增长率为－1.9，所以不是逐年增长，D项正确。
故正确答案为C。