解析：

2009年，六大高耗能行业各行业的投资增速分别为：
非金属矿物制品业28.0%＋15.5%＝43.5%；
化学原料及化学制品制造业14.8%＋12.1%＝26.9%；
电力热力的生产与供应业6.6%＋16.2%＝22.8%；
石油加工炼焦及核燃料加工业12.9%－12.5%＝0.4%；
有色金属冶炼及压延加工业35.8%－19%＝16.8%；
黑色金属冶炼及压延加工业－1.3%。
因此，投资增速最快的与最慢的行业的投资增速相差43.5%－（－1.3%）＝44.8%。
故正确答案为A。