解析：

文章中指出“应激激素还会改变胃脏与食管间的神经功能”，改变的是“神经功能”而非“肠神经系统化学物质”，因此A项错误；情绪的变化会刺激颅脑和肠脑作出反应，但在两者之间起连接作用的是“迷走神经”，而不是情绪的变化，因此B项错误；“自然法则保存了有独立功能的肠神经系统”中的“保存”一词说明肠神经系统是原本就存在的，所以C项中“形成”的表述错误；D项表述与原文相符。故选D。