解析：

本题属于主旨概括题型，主要考察概括类，本题对应的解法是：识别陷阱类型中概括不当，B、C、D选项都是概括不全，都只是文段内容的部分说明，相互的亲缘关系、胚胎关系、地理分布这些都是影响因素。寻找中心句，“生物的种和变种一样，是由以前别的种演变而来的，而不是分别创造出来的”，这一句话是对前面的总结，由于变种是种的演变而来的，而又是由以前别的种演变而来，所以生物的种的起源是演变而来的。所以，本题选择A答案。